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      DNA提取方法的總結(jié)!

      發(fā)布時(shí)間:2024-08-21
      dna提取方法的一些總結(jié):細(xì)菌dna的提?。?br>(一)
      試劑:
      1. 抽提緩沖液
      2% ctab (w/v)
      2% pvp k25 (w/v) (去色素)
      100mm tris-hcl (ph8.0)
      25mm edta (ph8.0)
      2.0m nacl
      2.10m licl
      3. 2m licl
      4.depc-water(抑制rna酶活性)
      5. 3m naac (ph5.2)
      6. 96% 乙醇
      7. 70% 乙醇
      步驟:
      1.抽提緩沖液65℃預(yù)熱;
      2. 加菌體到已經(jīng)預(yù)熱的緩沖液(700ul)中混勻,65℃,10min;
      3. 加酚/lv仿/異戊醇(25:24:1),振蕩,離心12,000rpm,10min;
      4.取上清,加lv/異戊醇(24:1)振蕩,離心12,000rpm,10min;
      5. 取上清,重復(fù)4步驟;
      6. 加入1/10體積的3m醋酸鈉和1.5倍體積的乙醇(或加入等體積的異丙醇),-20c沉淀;
      11. 離心12,000rpm,10min;
      12. 棄上清,70%乙醇洗,也可以再用100%乙醇洗,然后溶解于100ml 水中。
      (二)(我們常用的方法,但是有時(shí)有些細(xì)菌特別不好提,就用上面的方法)
      1. 將菌株接種于液體lb培養(yǎng)基,37℃震蕩培養(yǎng)過(guò)夜。
      2. 取1.5ml培養(yǎng)物12000rpm離心2min。
      3. 沉淀物加入567 ul的te緩沖液,反復(fù)吹打使之重新懸浮,加入30ul 10%sds和15ul的蛋白酶k,混勻,于37℃溫育1h.
      4. 加入100ul 5mol/l nacl, 充分混勻,再加入80ul ctab/nacl溶液,混勻后再65℃溫育10min。
      5. 加入等體積的酚/lv/異戊醇混勻,離心4-5min, 將上清轉(zhuǎn)入一只新管中,加入0.6-0.8倍體積的異丙醇,輕輕混合直到dna沉淀下來(lái),沉淀可稍加離心。
      6. 沉淀用1ml的70%乙醇洗滌后,離心棄乙醇.
      真菌dna的提?。?br>(一)
      1.取真菌菌絲0.5g, 在液氮中迅速研磨成粉
      2.加入4ml提取液,快速振蕩混勻
      3.加入等體積的4ml的lv:異戊醇(24:1),渦旋3~5min(此處是粗提沒(méi)有加酚,可以節(jié)約成本的喲!)
      4.1000rpm,4℃,5min
      5.上清用體積的lv:異戊醇(24:1)再抽提一次(10,000 rpm,4℃離心5 min)
      6.取上清,加入2/3倍體積的-20℃預(yù)冷異丙醇或2.5倍體積的無(wú)水乙醇沉淀, 混勻, 靜置約30 min
      7.用毛細(xì)玻棒挑出絮狀沉淀, 用75%乙醇反復(fù)漂洗數(shù)次, 再用無(wú)水乙醇漂洗1次, 吹干,重懸于500 ?ulte中
      8.加入1 ul rnasea (10 mg/ml),37℃處理1 hr
      9.用酚(ph8.0):lv仿:異戊醇(25:24:1)和lv仿:異戊醇(24:1)各抽提1次(10,000 rpm,4℃離心5 min)
      10.取上清,1/10v 3m naac,2.5v體積的無(wú)水乙醇, -70℃沉淀30 min以上
      11.沉淀用75%乙醇漂洗,風(fēng)干, 溶于200 ulte中,-20 ℃保存?zhèn)溆?br>dna提取液:0.2m tris-hcl(ph 7.5),0.5m nacl,0.01m edta,1%sds,
      3m naac
      (二)
      1.真菌菌絲0.5-1 g, 在液氮中迅速研磨成粉
      2.加入3 ml 65℃預(yù)熱的dna提取緩沖液,快速振蕩混勻65℃水浴30 min, 期間混勻2-3次
      3.加入1 ml 5m kac,冰浴20 min
      4.等體積的lv仿:異戊醇(24:1)抽提1次(10,000 rpm,4℃離心5 min)
      5.取上清,加入2/3倍體積的-20℃預(yù)冷異丙醇, 混勻, 靜置約30 min
      6.用毛細(xì)玻棒挑出絮狀沉淀, 用75%乙醇反復(fù)漂洗數(shù)次, 再用無(wú)水乙醇漂洗1次, 吹干,重懸于500 ?l te中
      7.加入1 ul rnasea (10 mg/ml),37℃處理1 hr
      8.用酚(ph8.0):lv仿:異戊醇(25:24:1)和lv仿:異戊醇(24:1)各抽提1次(10,000 rpm,4℃離心5 min)
      9.取上清,1/10v 3m naac,2.5v體積的無(wú)水乙醇, -70℃沉淀30 min以上
      10.沉淀用75%乙醇漂洗,風(fēng)干, 溶于200 ul te中,-20 ℃保存?zhèn)溆谩?br>注:僅供參考!
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